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马丹博士    

Dan Ma, Ph. D.


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“我愿将自己融入西湖大学的血液中,感受这个新生命的每一次呼吸与脉动。让我们共同努力,共同成长,共同书写西湖大学的奇迹!”注:对西湖大学的寄语)

 

      一、个人简介

      马丹,1987年生,河北廊坊人,从事结构生物学与生物化学相关研究;2009年毕业于山东大学生命科学学院,并获得理学学士学位; 2014年毕业于清华大学生命科学学院并获得理学博士学位;随后在美国华盛顿大学(西雅图)进行博士后研究,并获得Jane  Coffin Childs医学研究纪念基金会的支持。2019年起全职加入西湖大学生命科学学院(Principle Investigator),组建蛋白质结构与功能研究实验室。


      二、学术成果

      马丹博士长期从事蛋白质结构与功能的研究,尤其是在膜蛋白结构生物学研究领域取得了多项重要成果。

(1)解析了大肠杆菌抗酸系统重要组成蛋白谷氨酸:gamma-氨基丁酸反向转运蛋白GadC的晶体结构,揭示了其底物转运的分子机制,并基于生化与功能研究鉴定出一个全新的大肠杆菌抗酸系统。以上研究对于理解胃肠道致病菌的特性以及寻找相应疾病的防治方法具有重要意义。 

(2)首次获得了人源gamma-分泌酶复合物原子分辨率冷冻电镜结构,为理解阿尔兹海默症的发病机理奠定了基础。该工作入选了“2014年中国十大科技进展新闻”。(3) 获得了跨膜O-酰基转移酶超家族成员首个高分辨率晶体结构,并依据生化分析提出了可能的工作模型。研究结果为理解该超家族成员的催化机制以及进一步的研究提供了结构基础。以上各项研究成果获得了Faculty of 1000的专业点评与推荐。

         研究组将通过X射线晶体学、冷冻电镜等生物物理学方法,结合生物化学方法研究与人类健康和疾病密切相关的蛋白质及蛋白质复合物,尤其是膜蛋白的结构与功能。未来主要研究内容为氨基酸和脂类的转运与代谢,以及重要信号转导通路(例如Wnt信号通路)的调控。


三、代表论文 (*Equal contribution)

1. Ma D, Wang Z, Merrikh C, Lang K, Lu P, Li X, Merrikh H, Rao Z, Xu W. Crystal structure of a membrane-bound O-acyltransferase. Nature. 2018; 562(7726):286-290.

2. Bai XC, Yan C, Yang G, Lu P, Ma D, Sun L, Zhou R, Scheres SH, Shi Y. An atomic structure of human γ-secretase. Nature. 2015; 525(7568):212-7.

3. Xie T, Yan C, Zhou R, Zhao Y, Sun L, Yang G, Lu P, Ma D, Shi Y. Crystal structure of the γ-secretase component nicastrin. PNAS. 2014; 111(37): 13349-54.

4. Lu P*, Bai X*, Ma D*, Xie T, Yan C, Sun L, Yang G, Zhao Y, Zhou R, Sheres S, Shi Y. Three-dimensional structure of human γ-secretase. Nature. 2014; 512(7513):166-70.

 5. Lu P*, Ma D*, Yan C, Gong X, Du M, Shi Y. Structure and mechanism of a eukaryotic transmembrane ascorbate-dependent oxidoreductase. PNAS. 2014; 111(5):1813-8.

6. Ma D*, Lu P*, Shi Y. Substrate selectivity of the acid-activated glutamate/ γ-aminobutyric acid (GABA) antiporter GadC from Escherichia coli. J Biol Chem. 2013; 288 (21):15148-53.

7. Lu P*, Ma D*, Chen Y, Guo Y, Chen GQ, Deng H, Shi Y. L-glutamine provides acid resistance for Escherichia coli through enzymatic release of ammonia. Cell Res. 2013; 23(5):635-44.

8. Ma D, Lu P, Yan C, Fan C, Yin P, Wang J, Shi Y. Structure and mechanism of a glutamate-GABA antiporter. Nature. 2012; 483(7391):632-6.

 

四、联系方式

      电子邮箱:madan@westlake.edu.cn

      实验室自2019年开始招收博士研究生,附浙江西湖高等研究院与浙江大学、复旦大学的联合招生简章:

浙大:http://www.wias.org.cn/chinese-detail-509-8896.html

复旦:http://www.wias.org.cn/chinese-detail-509-8895.html  

      课题组诚聘具有生物物理学(X射线晶体学及冷冻电镜方向)、生物化学与分子生物学等相关背景的副研究员、助理研究员和科研助理。同时招聘行政助理(实验室管理员)。期待你的加入!