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马丽佳博士

     Lijia Ma, Ph. D. 

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“愿对科学与真理永保好奇与敬畏之心,大胆假设而小心求证。在科学探索之路上与西湖高等研究院并肩前行。”


一、个人简介

马丽佳,2003年本科毕业于苏州大学医学部。2004-2009年于中国科学院北京基因组研究所攻读博士学位,研究方向基因组学与生物信息学。2009年8月至12月于中国科学院遗传与发育生物学研究所短期访问。2010年1月至2014年11月在芝加哥大学基因组学与系统生物学研究所进行博士后研究。2014年12月晋升为Staff Scientist。自2016年4月起担任美国国立卫生研究院ENCODE项目co-Principal Investigator,modERN项目co-Principal Investigator,CEGS项目Key Personnel。


二、学术成果

随着各类组学技术的快速发展,生命科学正逐步从传统的、以单点观察为主的学科,走向以产生和分析数字化组学信息(如基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组等)与功能实验验证相结合的学科。对具体生物学问题的研究也从关注单个突变、单个基因、单个蛋白逐步转向系统化研究。

马丽佳博士长期从事系统生物学研究工作。以顺势调控元件(cis- elements)和反式作用因子(trans- regulator)等转录水平调控、以及mRNA修饰等转录后水平调控为切入点,通过结合功能基因组学实验与计算生物学方法,来研究基因表达和蛋白表达多样性的调控基础。实验室重点关注调控变化对干细胞分化、胚胎发育、癌症与代谢性疾病发展的影响,以及各级调控之间的相互作用(crosstalk)。同时关注各类前沿实验技术(如单细胞测序、CRISPR)和生物信息学分析方法的应用与开发。将“湿实验”与“干实验”相结合,“科学探索”与“技术开发”相结合。

Google Scholar: https://goo.gl/hzbD99


三、代表论文

* These authors contributed equally

1. Ma L, Zhao B, Chen K, Thomas A, Tuteja JH, He X, et al. Evolution of transcript modification by N6-methyladenosine in primates. Genome Res. 2017;27(3):385-92. Cover Story

2. Slattery M*, Ma L*, Spokony RF*, Arthur RK, Kheradpour P, Kundaje A, et al. Diverse patterns of genomic targeting by transcriptional regulators in Drosophila melanogaster. Genome Res. 2014;24(7):1224-35. Cover Story

3. Song X*, Wang D*, Ma L*, Chen Z, Li P, Cui X, et al. Rice RNA-dependent RNA polymerase 6 acts in small RNA biogenesis and spikelet development. Plant J . 2012;71(3):378-89.

4. Chen X*, Hu Z*, Wang W*, Ba Y*, Ma L*, Zhang C*, et al. Identification of ten serum microRNAs from a genome-wide serum microRNA expression profile as novel non-invasive biomarkers for non-small cell lung cancer diagnosis. Int J Cancer. 2011; 130(7),1620-1628.

5. Negre N*, Brown CD*, Ma L*, Bristow CA*, Miller SW*, Wagner U*, et al. A cis-regulatory map of the Drosophila genome. Nature. 2011;471(7339):527-31.

6. modENCODE Consortium. Identification of functional elements and regulatory circuits by Drosophila modENCODE. Science. 2010;330(6012):1787-97.

7. Li G*, Ma L*, Song C, Yang Z, Wang X, Huang H, et al. The YH database: the first Asian diploid genome database. Nucleic Acids Res. 2009;37.

8. Chen X*, Ba Y*, Ma L*, Cai X, Yin Y, Wang K, et al. Characterization of microRNAs in serum: a novel class of biomarkers for diagnosis of cancer and other diseases. Cell Res. 2008;18(10):997-1006.

9. Li S*, Ma L*, Li H*, Vang S, Hu Y, Bolund L, et al. Snap: an integrated SNP annotation platform. Nucleic Acids Res. 2007;35: D707-10.


四、联系方式

电子邮箱:malijia@westlake.edu.cn

招聘链接:http://www.wias.org.cn/chinese-detail-373-10319.html